Propiciar la investigación científica sobre plantas y hongos en sus diferentes enfoques.
Desarrollar proyectos de investigación básica y aplicada en el campo de la Botánica y Hongos.
Contribuir a la formación de recursos humanos de grado y post grado a través de la docencia y la interacción con los estudiantes de diferentes niveles.
Implementar acciones concretas para establecer vínculos con la comunidad, a través de los servicios de Extensión, de manera a crear conciencia sobre los beneficios que acarrean a la sociedad los productos de la investigación científica en plantas y hongos.
Fortalecer el Herbario FACEN a través de las muestras de especímenes botánicos resultantes de los trabajos de investigación además de los intercambios realizados con otros herbarios.
Facilitar la divulgación de los resultados de trabajos de investigación.