La colección del Herbario FACEN son el resultado de trabajos de investigadores, de estudiantes de grado y post grado del Departamento de Biología, en temas como Florística, Taxonomía, Ecología, Fitosociología, Botánica Económica y Etnobotánica y  está constituida con especímenes de angiospermas, briófitas, líquenes y hongos. 

La Base de Datos y la virtualización de los especímenes de plantas y hongos de la colección se actualizan constantemente.